Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARF5P84085 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF5P84085 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF5P84085 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms