Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX1P83916 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms