Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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