Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms