Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP1P29466 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms