Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms