Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IL3RAP26951 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms