Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PLNP26678 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms