Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRZ1P23471 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms