Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XPAP23025 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XPAP23025 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms