Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms