Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DPA1P20036 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms