Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms