Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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