Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VCLP18206 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VCLP18206 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCLP18206 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCLP18206 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms