Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA4P13612 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms