Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD4P09016 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD4P09016 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXD4P09016 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXD4P09016 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXD4P09016 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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