Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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