Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf47O95873 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf47O95873 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf47O95873 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms