Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms