Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCATO75600 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCATO75600 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms