Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms