Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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