Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E9PBE3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E9PBE3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms