Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms