Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms