Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LINC00587B1AMM8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LINC00587B1AMM8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LINC00587B1AMM8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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LINC00587B1AMM8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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LINC00587B1AMM8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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