Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms