Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms