Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHKBQ9Y259 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms