Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms