Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHORDC1Q9UHD1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms