Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RDH8Q9NYR8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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