Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms