Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SERINC1Q9NRX5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms