Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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