Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFGAP3Q9NP61 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms