Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms