Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms