Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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