Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms