Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRAMD1AQ96CP6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms