Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RABGGTAQ92696 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGGTAQ92696 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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