Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms