Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms