Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms