Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AVL9Q8NBF6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms