Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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