Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C15orf39Q6ZRI6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms