Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms